- 더빙: 일본어 (5.1 Dolby Digital) 한국어 (Stereo)<br/>- 자막: 한국어, 일본어, 영어<br/>- 화면: 1.85:1 Anamorphic widescreen<br/><br/><br/>

[1편] 제 1~ 4화
[2편] 제 5~ 8화
[3편] 제 9~ 12화


제 1화
아톰의 탄생!
2003년. 메트로 시티의 과학청 안에선 놀라운 실험이 벌어지고 있었다. 그곳은 인간과 비슷한 두뇌를 가진 로봇을 탄생시키는 곳이었다. 마침내 문제의 로봇인 아톰이 탄생하지만 굉장한 로봇을 기대했던 다른 과학자들은 마치 유치원생 같은 아톰의 행동거지에 실망을 금치 못한다. 한편 연구실 밖의 세상을 보게 된 아톰은 호기심을 참지 못하고 밖으로 뛰쳐 나가는데...

제 2화
로봇 볼 대회!
메트로 시티에서 가장 인기 있는 스포츠, 로봇 볼. 아톰은 새로 사귄 친구들과 로봇 볼을 즐긴다. 한편 로봇 볼 월드 시리즈 경기가 치러지고 있는 메트로 시티 경기장에선 페어 플레이로 유명한 할리 선수가 갑자기 무지막지한 반칙을 거듭하는데...

제 3화
우주에 간 아톰!
행성 데이모스의 채굴 로봇이 갑자기 인간의 명령에 거역하며 이상한 행동을 하기 시작한다. 보고를 받은 코주부 박사는 데이모스로 향하고 아톰은 집을 지키란 명령을 받지만 결국은 몰래 박사를 쫓아간다. 이들이 도착한 행성 데이모스는 자기 멋대로 굴을 파는 채굴 로봇 때문에 혼란에 빠져 있었고 아톰은 이곳에서 사람을 구하며 로봇들이 반란을 일으킨 이유를 조사한다.

제 4화
투명 로봇 시엘!
학교에 가기 시작한 아톰에게 에디, 동구, 황보라는 새 친구들이 생긴다. 거기다 아톰은 투명 인간처럼 모습을 사라지게 할 수 있는 로봇 시엘과 친구가 된다. 하지만 시엘은 악당 스컹크가 조종하는 도둑이었다. 아톰은 어떻게든 시엘을 말리려고 하지만 시엘은 자신도 학교에 다니기 위해선 도둑질을 꼭 해야 한다고 하는데...

제 5화
로봇 농장을 구하라!
무지개 계곡에 있는 한 농장. 거기에선 베지타라는 로봇들이 거대한 야채를 지배하고 있었다. 근데 거기에 프러드라는 청년이 나타난다. 프러드는 로봇에 대한 증오심을 가지고 있는 사람으로 농장에서 일하는 로봇들의 평판을 떨어뜨리기 위해서 농장의 주인인 토네리코 박사와 손녀딸인 미미에게 접근해 여러가지 음모를 꾸미는데...

제 6화
아틀라스의 탄생!
한 재벌의 총수가 고명한 박사에게 자신의 죽은 아들과 똑같이 생긴 로봇을 반들어 달라고 의뢰한다. 이 재벌은 그 로봇에게 자신의 재산을 물려줄 생각이었던 것이다. 하지만 고명한 박사에 의해 만들어진 로봇은 자신의 아버지와 인간을 미워하는 기억을 주입 당한 탓에 스스로의 이름을 아틀라스라고 바꾼 다음 사람들을 공격하기 시작한다.


제 7화
아톰과 아틀라스의 대결
아톰의 기억이 되살아 난 사실을 알게 된 코주부 박사는 모든 사실을 아톰에게 알린다. 그것은 아톰을 만든 사람이 고명한 박사이며 아톰은 고명한 박사의 아들인 철이 대신 만들어졌고 결국은 버림을 받았다는 것이었다. 그 무렵 아톰에게 패한 아틀라스는 고명한 박사를 찾아가 더욱 더 강한 몸으로 강화된다. 이윽고 아틀라스는 우주 정거장을 파괴하기 위해 달로 향하는데...

제8화
초특급 열차의 위기
사상 최초의 로봇형 기차 네온 라이트 호에 니트로 박사가 폭탄을 설치한다. 그 폭탄은 기차가 시속 700Km를 넘는 순간 폭발하는 장치가 달려있었다. 마침 그 기차에 타고 있던 아톰과 유식한 박사는 승객들을 구하기 위해서 필사적으로 폭탄을 찾지만 그 일이 쉽지만은 않은데...

제 9화
프랑켄슈타인
어느 산속 깊은 곳에 부서진 로봇들이 수북이 쌓여있는 곳이 있었다. 어둠의 업자들이 로봇을 유괴해 비싼 부품만 빼낸 다음 나머지 부속을 그곳에 버린 것이다. 그런데 그 중에 한 로봇이 갑자기 일어선다. 그리고 자신의 부족한 부품을 메우듯이 수많은 부품을 흡수해서 점점 거대해진다. 마치 프랑켄슈타인 같은 모습의 그 로봇은 이윽고 사람들이 사는 마을로 향하는데...

제10화
금성 로봇의 습격!
바다 속에서 의문의 물체가 발견된다. 그것은 20년 전 사용되지 않고 바다 속에 폐기된 금성 로봇이었다. 아톰은 자신들이 무엇을 위해 태어났는지 잊어버린 금성 로봇이 바다 속에서 마을을 세우고 자신들을 이끌어줄 지도자를 기다리고 있다는 사실을 알게 된다. 한편 금성 로봇의 존재를 알게 된 고명한 박사는 이들을 이용 하려 하는데...

제 11화
로봇 서커스단!
휴양을 위해 온천 마을을 찾은 아톰과 코주부 박사는 그곳에서 로봇 서커스 구경을 하게 된다. 그때 아톰은 서커스단 속에 인간 소년이 있다는 사실을 알게 된다. 리노는 어렸을 때 버려진 아이로 그 동안 서커스 단의 로봇들이 키워준 것이었다. 한편 로봇을 싫어하는 구스타프는 리노의 비밀을 알게 되고 로봇들을 함정에 빠뜨리기 위해 로봇이 소년을 납치했다는 소문을 퍼뜨린다. 결국 로봇들은 분해 당할 위기에 처하는데...

제12화
되살아난 점보!
해상 공원의 구석엔 고물이 되어 사람들로부터 잊혀진 로봇 점보가 있다. 그런데 그 점보가 악당들에 의해 다시 움직일 수 있게 된다. 악당들의 목적은 점보를 이용해 감옥에 갇힌 스컹크를 탈주시키는 것이었다. 어렸을 때 부터 점보를 보고 커온 아톰의 담임 선생님은 어떻게든 점보를 말리고자 하지만 일이 쉽지만은 않은데...